O Herbário HUEFS possui 500 m² de área construída, com estrutura que inclui secretaria, salas de computação, identificação, curadoria e uma coleção geral com armários compactadores. Com mais de 250.000 espécimes de algas, fungos e plantas, é o maior herbário do Nordeste e o 5º do Brasil, sendo referência no estudo da flora do semiárido. Lidera projetos de grande porte e apoia pesquisas sobre biodiversidade e interações ecológicas. O curador-chefe é o Dr. Luciano Paganucci de Queiroz, do PPGEcoEvol.